تشرف وزارة التعليم العالي على مراحل التعليم الجامعي، و مؤخرا أصبح من حق الجهات الخاصة إنشاء و إدارة الجامعات والمعاهد.
كما يوجد نمط مواز للتعليم يشرف عليه الأزهر في كل مراحل التعليم، انتهاء بجامعة الأزهر الذي تدرس العلوم الشرعية إلى جانب "الدنيوية".
يوجد في مصر 23 جامعة حكومية، بالإضافة إلي أكثر من 10 جامعات خاصة. هذا بجانب العديد من المعاهد العليا الحكومية والخاصة.